روز پنج‌شنبه ۱۱ دی‌ماه ۱۳۹۳ ماموران امنیتی با حکم ویژه دادگاه روحانیت به خانه‌ی آقای نکونام در قم وارد شدند و علاوه بر تخریب وسایل و لوازم بیت این روحانی شیعه او را بازداشت کردند.
در وب‌سایت این روحانی شیعه آمده است که ایشان بیش از صد مقاله و کتاب در عناوین مختلف فقهی نوشته است. این آیت‌الله از مدرسان درس خارج فقه حوزه‌ی علمیه‌ی قم است. زمانی پیش‌تر دادگاه ویژه‌ی روحانیت از توزیع رساله‌ی فقهی او نیز جلوگیری کرده بود.
لازم به ذکر است که این روحانی متولد ۱۳۲۷ گلپایگان در اردیبهشت ۱۳۹۳ در درس خارج فقه خود از اجرای طرح توزیع یارانه انتقاد کرده بود و گفته بود: «توزیع یارانه نقدی دربین مردم نشانه برنامه نداشتن دولت درحوزه اقتصاد بود. این‌کار مثل آن است که پدرخانواده به جای برنامه ریزی برای زندگی فرزندانش پول‌ها را روی سر آن‌ها بریزد یا چون پدر و مادری است که شاغل‌اند و به فرزندان پول می‌دهند که نهار بروید ساندویچ بخورید.»
پس از بازداشت این روحانی تعدادی از شاگردان این روحانی نیز بازداشت شده‌اند. از شرایط بازداشت و زندان و اتهامات این روحانی معترض اخبار چندانی در دسترس نیست.
پروفایل او را در دیتابیس زندانیان سیاسی در سایت اتحاد برای ایران ببینید:
http://bit.ly/19oGRRJ